Н.А. Меншуткин вёл большую работу в обществе. Как делопроизводителю ему приходилось решать все текущие дела, вести переписку с учёными, представлять общество в других общественных организациях. По его инициативе завязываются регулярные связи с иностранными объединениями химиков. Русское химическое общество стало обмениваться протоколами заседаний и другими материалами с Немецким, Чешским, Английским, Парижским и другими химическими обществами. Русское химическое общество занималось самым различными делами. По просьбе петербургской городской управы оно занялось проблемой газового освещения улиц. Н.А. Меншуткин вместе с Д.И. Менделеевым и другими учёными вошёл в созданную для решения этой комиссию. После ознакомления с состоянием газового хозяйства комиссия представила доклад, содержащий исчерпывающие рекомендации и указания.

Общество работало и над созданием русской химической номенклатуры. В комиссию по разработке номенклатуры поступали многочисленные предложения. Среди массы дельных предложений попадались и просто курьёзные. Было, например, предложение строить названия соединений с такими окончаниями, которые содержатся в русских именах, отчествах и фамилиях. Так, хлористый калий должен был называться калий хлорович, хлорноватокислый калий KCl03 – калий хлорович трёхкислов и т.д. В конце 1870 комиссия закончила свою работу. И хотя она не вынесла определённого решения, её документы послужили базой для последующей разработки русской химической номенклатуры. В начале 1876 года, Д. И. Менделеев выступил с предложением о слиянии двух обществ. Этому немало способствовала совместная работа над «Журналом…», а также желание увеличить значение общества для научной жизни страны. Через два года, в 1878 году, было официально создано Русское физико-химическое общество с двумя автономными отделениями: физическим и химическим. В 1878г. Русское химическое общество участвовало в Лондонской всемирной выставке. Благодаря усилиям Н.А. Меншуткина от Академии наук, Медико-хирургической академии других научных учреждений на выставку была представлена богатая коллекция химических веществ и приборов, уступавшая по количеству экспонатов только коллекции Немецкого химического общества. Русских химиков представлял на выставке президент общества Н.Н. Зинин.

Редакторская работа требовала от Николая Александровича напряжённого труда. Первые 10 лет он сам читал корректуру всех статей. Как редактор он переписывался с авторами, часто помогал советами. Молодым учёным он подсказывал, как лучше расположить материал в статье, на чём акцентировать внимание. В конце 1872 г. Н.А. Меншуткин и В.В. Марковников предложили начать публиковать в нём рефераты статей иностранных журналов. Так в «Журнале Русского химического общества « появился второй отдел - реферативный. В1878 г. Произошло слияние Русского химического общества и Русского физического общества. Делопроизводителем объединённого общества и редактором его печатного органа- «Журнала Русского физико-химического общества»- остался Н.А. Меншуткин.

Объём работы в обществе с годами всё увеличивался. Н.А. Меншуткину всё труднее становилось совмещать выполнение своих обязанностей в обществе с научной и педагогической деятельностью. В 1892 г. он попросил освободить его от обязанностей редактора. Прежде чем приступить к выборам нового редактора, на заседании отделения химии с речью выступил председатель отделения Н.Н. Бекетов, который сказал: «Передо мной лежит первый том «Журнала Русского химического общества» 1869 г., и на нём стоит подпись – «под редакцией Н.А. Меншуткина», - и вот с тех пор прошёл 31 год. Итак, издание нашего журнала,т.е. единственного нашего литературного органа, выражающего учёную деятельность нашего общества,или,лучше сказать, деятельность всех русских химиков, было организовано и постоянно развивалось и пополнялось единственно благодаря неусыпным трудам Н.А. Меншуткина, вложившего, можно сказать, в это издание всю свою душу. Наше общество, а с ним и все наши химики обязаны бесконечной благодарностью тому, который а продолжение стольких лет совершенно безвозмездно нёс на себе трудную обязанность редактора, организовал в нём разные отделы (протоколы, оригинальные работы, обзор опытных работ и отчёты о деятельности провинциальных обществ и съездов). Поэтому естественно, что наше общество нравственно обязано почтить эту полезную деятельность уважаемого сочлена и, можно сказать, главного деятеля в жизни нашего общества». В ознаменование32-летней деятельности Николая Александровича на посту редактора журнала было решено сохранить на титульном листе «Журнала Русского физико-химического общества» имя Н.А. Меншуткина, прибавив к заглавию журнала новую строку: «С 1869 по 1900 год под редакцией Н.А. Меншуткина и речью Н.Н. Бекетова, в которой он характеризует редакторскую деятельность Николая Александровича.